1.應安放于衛生條件較好的地方，便于清潔，門窗能夠密封以避免外界的污染空氣對室內的影響。
2.安放位置應闊別有震動及噪音大的地方。
3.嚴禁安放在產生大塵粒及氣流大的地方，以保證操縱區空氣的正常活動。
4.接通超凈工作臺的電源，旋開風機開關，使風機開始正常運轉，這時應檢查高效過濾器出風面是否有風送出。
5.檢查照明及紫外設備能否正常運行，如不能正常運行則通知工程部檢驗。
6.工作前必須對工作臺四周環境及空氣進行超凈處理，認真進行清潔工作，并采用紫外線滅菌法進行滅菌處理。
7.凈化工作區內嚴禁存放不必要的物品，以保持潔凈氣流活動不受干擾。
8.使用工作臺時，先經過清潔液浸泡的紗布擦拭臺面，然后用消毒劑擦拭消毒。
9.接通電源，提前50分鐘打開紫外燈照射消毒，處理凈化工作區內工作臺表面積累的微生物，30分鐘后，封閉紫外燈，開啟送風機。
10.工作臺面上，不要存放不必要的物品，以保持工作區內的潔凈氣流不受干擾。
11.操縱結束后，清理工作臺面，收集各廢棄物，封閉風機及照明開關，用清潔劑及消毒劑擦拭消毒。
12.最后開啟工作臺紫外燈，照射消毒30分鐘后，封閉紫外燈，切斷電源。
13.每仲春用風速計丈量一次工作區均勻風速，如發現不符合技術標準，應調節調壓器手柄，改變風機輸進電壓，使工作臺處于最佳狀況。
14.每月進行一次維護檢查，并填寫維護記錄。
15.每次使用完畢，立即清潔儀器，懸掛標識，并填寫儀器使用記錄。
16.取樣結束后，先用毛刷刷往潔凈工作區的雜物和浮塵。
17.用細軟布擦拭工作臺表面污跡、污垢目測無清潔劑殘留，用清潔布擦干。
18.要經常用紗布沾上酒精將紫外線殺菌燈表面擦干凈,保持表面清潔,否則會影響殺菌能力.
19.效果評價：設備內外表面應該光亮整潔，沒有污跡。