隨著GMP、SSOP等管理規范在食品行業的實施，對食品生產的環境也不斷提出新的要求。一些食品廠將藥品生產中應用較成熟的風淋室潔凈工藝引入食品生產中，作為生產過程中保障。過去，操控食品生產車間微生物污染的主要方法是采用低溫，利用化學噴霧、臭氧和紫外線等。這些方法存在著一些副作用。
現代化的食品廠采用風淋室潔凈工藝操控生產環境取得了巨大的成果，由于潔凈工藝、有效，已成為操控整個食品生產過程中消除微生物不可替代的工藝措施。這是因為風淋室生物潔凈工藝的提出和發展從根本上消除了滋生的條件，抑制或降低發生，切斷了所有潛在的污染傳播途徑，有效地操控了有害的生物氣溶膠，解決了空氣途徑的污染。
風淋室關鍵操控點理念改進了全過程操控，引入食品生產行業，用局部凈化操控措施替代了全操控，由于隔離工藝直接作用在關鍵操控生產環境，將*大的微生物污染源——人從生產的無菌關鍵區域完全隔離開來，限制了無菌生產操作人員與無菌產品的干預或直接接觸，使得生產受其他因素影響的概率大大減少，減少了無菌加工的污染風險，同時也因操控體積的減少而大大降低了能耗。
生物潔凈工藝不單純以來化學，而是采用三級過濾保證送入潔凈無菌的空氣;通過合理的換氣次數和特定的氣流組織方式來稀釋和排擠室內的含菌空氣;通過有序的壓力梯度來保證氣流的定向流動，防止交叉污染。